本系列音乐使用极具个性。
不同篇章的配乐既会保持总体连贯，也会明显区分各部氛围。
第一季《幻影之血》与《战斗潮流》甚至由不同作曲家分别负责。
之后第二季到第六季则主要由菅野祐悟负责音乐。
系列片尾曲的一大特色，是大量采用现成欧美流行或摇滚名曲。
这些选曲通常依据荒木飞吕彦创作时听过的音乐，或与对应篇章气质最接近的作品。
第一季主题歌
第一部片头曲为《JOJO～那血脉的命运～》，由富永TOMMY弘明演唱。
这首歌带有强烈的经典动画歌曲风格，气势十足。
第二部片头曲为《BLOODY STREAM》，由Coda演唱。
这首歌更时髦、更轻快，也与乔瑟夫·乔斯达狡黠灵活的个性十分贴合。
第一季片尾曲使用了YES乐队的《Roundabout》。
这首歌后来因动画播出带来极高话题性，销量也大幅增长。
第二季主题歌
前半片头曲为《STAND PROUD》，由桥本仁演唱。
歌曲展现出空条承太郎的强硬与冷峻气质。
后半埃及篇片头曲为《JOJO 那血脉的记忆～end of THE WORLD～》。
由富永TOMMY弘明、Coda与桥本仁组成的组合共同演唱。
第二季前半片尾曲为The Bangles的《Walk Like an Egyptian》。
后半片尾曲则是Pat Metheny Group的《Last Train Home》。
第二季还推出了以反派角色为中心的特殊片尾曲《恶役协奏曲》。
相关桥段因风格独特而广受观众喜爱。
第三季主题歌
第三季共有三首片头曲。
分别是《Crazy Noisy Bizarre Town》《chase》和《Great Days》。
片尾曲为Savage Garden的《I Want You》。
这首歌与杜王町那种明亮却暗藏危机的气氛形成了有趣对照。
本季还出现了著名的“倒放片头”演出。
吉良吉影发动能力后，片头被逆向处理，成为系列经典名场面之一。
第四季主题歌
第四季前半片头曲为《Fighting Gold》，由Coda演唱。
后半片头曲为《背叛者的安魂曲》，由哈塞川大辅演唱。
前半片尾曲为Jodeci的《Freek'n You》。
后半片尾曲为Enigma的《Modern Crusaders》。
到了故事后段，片头会根据迪亚波罗或乔鲁诺·乔巴拿的能力发生特殊变化。
这种“片头被角色能力侵入”的玩法，也成为本系列的固定惊喜之一。
第五季主题歌
第五季前半片头曲为《STONE OCEAN》，由岸田教团与THE明星火箭的ichigo演唱。
后半片头曲为《Heaven's falling down》，由sana演唱。
片尾曲为Duffy的《Distant Dreamer》。
歌曲上线后因动画带动，在日本流媒体平台播放量迅速暴涨。
第五季片头由神风动画时隔多年再度负责。
最终话更加入历代主角登场的特别演出，被视作全系列情感高潮之一。